ABO血型基因分型中靶向捕获二代测序技术的建立

作者：梁爽; 吴凡; 苏宇清; 梁延连; 洪文旭; 徐筠娉

来源：中国输血杂志, 2020, 33(09): 881-885.

DOI：10.13303/j.cjbt.issn.1004-549x.2020.09.005

• ABO血型鉴定
• 基因分型
• 二代测序
• 多重PCR捕获
• 全基因测序
• 血清学
• PCR-SSP
• Sanger测序

目的建立以多重PCR捕获为基础的ABO血型基因二代测序(next-generation sequencing,NGS)分型技术,结合血清学鉴定技术,对ABO血型准确定型。方法开发用于ABO血型的多重PCR捕获的NGS技术,靶向捕获ABO基因全序列建立DNA文库,利用Illumina NGS平台对20例深圳市血液中心健康无偿献血者血液标本做ABO基因测序分型;同时用血型血清学方法、PCR-SSP基因分型方法、以及第6、7外显子Sanger测序对同一批标本做ABO血型鉴定,以验证这种NGS技术做ABO血型鉴定的准确性。结果 1)利用新建立的靶向捕获二代测序技术对20例健康无偿献血者血液标本ABO基因的测序分析:平均测序深度为4 667±893,特异性与均一性分别为92.59%和92.47%,测序深度>20覆盖度为98.25%,均得到了唯一的分型结果。2)新建立的靶向捕获二代测序技术对于20例标本做的ABO全基因测序分型所得结果与血清学鉴定方法和基因分型技术的结果相符。结论成功建立了ABO基因多重PCR靶向捕获NGS测序技术,可以满足ABO血型的鉴定要求。

• 单位
  深圳市血液中心