牦牛GSTK1基因序列特征分析及其组织表达谱构建

作者：潘帮婷; 熊显荣^*; 于海玲; 杨满珍; 胡宇磊; 朱艳锦; 费熙熙; 李键^*

来源：西南民族大学学报(自然科学版), 2022, 48(06): 598-605.

• 牦牛
• GSTK1基因
• 序列特征
• 生物信息学
• 组织表达谱

旨在探讨谷胱甘肽硫转移酶K1(Glutathione S-Transferase Kappa1,GSTK1)基因序列特征.以牦牛为试验对象，通过RT-PCR技术扩增GSTK1基因序列并分析生物信息学，采用RT-qPCR技术构建其在牦牛不同组织中的表达谱.ORF分析显示，牦牛GSTK1基因编码区为618 bp,编码氨基酸为205个.系统发育树分析显示，牦牛与野牦牛(99.68%)、黄牛(99.68%)和野牛(99.40%)之间的同源性最高，与北极熊(87.63%)、野猪(87.25%)和马(87.01%)之间的同源性最低.蛋白预测分析显示，GSTK1蛋白为不稳定的亲水蛋白，存在12个磷酸化位点.高级结构预测分析显示，GSTK1蛋白的主要成分为α-螺旋(50.73%)、无规卷曲(40.00%)和延伸链(9.27%).组织表达分析发现GSTK1在所检测牦牛卵巢、小肠、脾、肝、肾、肌肉、肺和心组织中均有表达，其中表达量最高的组织是肝，表达量最低的组织是脾和心，且与其他组织差异显著(P<0.05).本研究获得了牦牛GSTK1基因的序列特征及组织表达谱，为进一步挖掘牦牛GSTK1基因的功能提供参考依据.

• 单位
  西南民族大学