一种基于iSRM策略的蛋白质组质谱数据分析工具

作者：张伟; 卫军营; 贾婷; 徐长明; 张纪阳; 朱云平; 钱小红; 张养军; 谢红卫

来源：质谱学报, 2013, (01): 15-22.

• 智能选择反应监测(iSRM)
• 质谱分析
• 蛋白质组
• 分析工具
• 可重复性能
• 线性性能 intelligent selected reaction monitoring(iSRM)
• mass spectrometry analysis
• proteomics
• analysis tool
• reproducibility
• linearity

由于重复性好、定量精度高,基于质谱的选择反应监测(SRM)技术在蛋白质定量分析中的应用越来越广泛。智能选择反应监测(iSRM)是一种新型的SRM实验策略。针对该策略产生的质谱数据,开发了一个肽段定量信息提取工具——iSQuant。该工具使用MATLAB脚本语言编写,简便易用。利用重复实验数据和标准实验数据对iSQuant的性能评估表明,iSQuant具有优越的可重复性能,定量结果和理论丰度线性度很高。

• 单位
  北京蛋白质组研究中心; 自动化学院; 国防科学技术大学; 山东中医药大学; 军事医学科学院放射与辐射医学研究所; 蛋白质组学国家重点实验室