中性粒细胞型哮喘差异表达基因的生物信息学分析及其潜在治疗药物筛选

作者：宋伟华; 谢欣辛; 秦琼; 范国荣^*

来源：中国药理学通报, 2021, 37(06): 861-866.

• 生物信息学
• 中性粒细胞型哮喘
• 差异表达基因
• 补体
• 芍药苷元酮
• 雷公藤甲素

目的运用生物信息学方法与分子对接技术筛选中性粒细胞型哮喘(neutrophilic asthma, NA)的差异表达基因(DEGs)及其潜在治疗药物,为其治疗提供新的靶点和药物。方法从GEO数据库筛选NA与健康人群的DEGs,通过STRING数据库构建DEGs的蛋白互作(PPI)网络筛选关键基因,并对DEGs进行GO功能注释与KEGG通路富集分析,采用分子对接技术筛选潜在的先导化合物。结果共筛选出147个DEGs; PPI网络分析筛选出CXCL8、FPR2、CXCL1、TNFRSF1B、CXCR1等10个关键基因;GO分析表明DEGs参与炎症与免疫反应、趋化作用等生物过程;KEGG通路分析显示DEGs主要富集于细胞因子-细胞因子受体相互作用、补体与凝血等信号通路;分子对接显示芍药苷元酮与雷公藤甲素与补体与凝血通路中C8B、PLAU等基因蛋白具有很好的结合活性。结论本研究发现补体与凝血信号通路或许可以成为NA新的治疗靶点,芍药苷元酮与雷公藤甲素是潜在的治疗药物。

• 单位
  上海交通大学; 上海市皮肤病医院; 苏州大学附属第一医院