基于SNP和SSR分子标记的番茄种质资源遗传多样性分析

作者：王涛; 扈艳萍; 朱华; 张子君; 邹庆道^*

来源：分子植物育种, 2020, 18(15): 5143-5149.

DOI：10.13271/j.mpb.018.005143

• 番茄
• 遗传多样性
• SNP
• SSR

为分析不同番茄种质的遗传多样性,利用120个SNP和29个SSR标记对210份番茄自交系进行基因分型。结果表明,SSR具有较高的多态性,而SNP检测到更高的基因多样性。在预先划分的3个亚群中,樱桃番茄遗传变异最高,常规番茄品种次之,现代番茄品系最低,说明早期育成的番茄品种仍具有较为丰富的遗传多样性。群体结构分析发现,SNP可将3个亚群区分开,同时常规番茄进一步分为粉果番茄和红果番茄2个小亚群。SSR的分析结果与SNP和预先的分类并不一致,未能将常规番茄和现代品系完全区分开。遗传距离分析显示,SNP具有更高的分辨率,可以区分所有供试材料,有6对材料组合未被SSR数据区分开。总的来说,在栽培番茄遗传多样性分析中,SNP标记具有更高的效率。

• 单位
  辽宁职业学院; 辽宁省农业科学院