基于荧光SSR分析中国原产苹果属植物17个种的遗传多样性和遗传结构

作者：高源; 王大江; 王昆^*; 丛佩华^*; 李连文; 朴继成

来源：果树学报, 2020, 37(11): 1611-1622.

DOI：10.13925/j.cnki.gsxb.20200166

• 苹果属
• 中国原产
• 荧光SSR
• 遗传多样性
• 遗传结构

【目的】为探讨中国原产苹果属植物的遗传多样性水平以及种群间和种群内的遗传分化程度,利用荧光SSR分子标记,对新收集的中国原产苹果属植物17个种798份种质资源的遗传多样性和遗传结构进行分析。【方法】筛选19对多态性好的SSR引物检测苹果属植物17个种的多态性,利用GenAlEx 6.501计算遗传多样性指标、分析种群间的分子变异(AMOVA),利用GenepopV4和Fstat293分析种群间的遗传分化,使用STRUCTURE 2.3.4进行贝叶斯聚类并分析种群的遗传结构。【结果】19对SSR引物共检测出500个多态性等位基因,平均等位基因数为26.3,平均有效等位基因数为10.309,观察杂合度和期望杂合度的平均值分别为0.681和0.886,香农多样性指数为2.545。山荆子的观测等位基因数最多,为19.947;中国苹果的有效等位基因数和香农多样性指数最高,分别为9.585和2.418;13个种群内遗传变异占93%,而种群间的遗传变异仅占7%,遗传变异不显著(p> 0.001)。楸子和中国苹果间的遗传分化系数最低,为0.006;变叶海棠和湖北海棠间的遗传分化系数最高,为0.253。【结论】17种苹果属植物的遗传多样性高于前人对苹果属植物野生种的研究。遗传分化主要存在于种群内,各种群间有基因交流,但同时又抵制了由于基因漂变而导致的种群间的遗传分化。新疆野苹果和山荆子可能参与了部分中国苹果的演化过程,除此之外,八棱海棠也可能参与了部分中国苹果的起源演化过程。

• 单位
  中国农业科学院果树研究所