AP-PCR结合进化树分析在幽门螺杆菌地域起源特征研究中的价值

作者：刘炯; 王忠灿; 金鑫鑫; 汪芳裕; 陈春燕; **凯; 朱乐明; 陆恒; 施慧

来源：中国微生态学杂志, 2012, (03): 197-203.

DOI：10.13381/j.cnki.cjm.2012.03.010

• 随机引物PCR
• 幽门螺杆菌
• NADH脱氢酶
• 进化树分析 AP-PCR
• Helicobacter pylori
• NADH dehydrogenase
• Phylogenetic tree

目的探讨随机引物PCR(Arbitrary primer PCR,AP-PCR)结合克隆测序及生物信息学分析等方法在研究幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,H.pylori)菌株地域起源特征中的价值和意义。方法针对临床分离培养的H.pylori菌株的基因组DNA,采用一组10 nt的寡核苷酸引物进行随机PCR扩增,选取相对保守的片段进行回收、克隆及测序,测序的基因序列提交GenBank数据库进行序列相似性的BLAST比对,收集BLAST比对得到的同源性较高不同地域来源螺杆菌的对应序列,用ClustalX软件进行排序,采用Mega 4.0软件中的邻位相连法(Neighbor-jo...

• 单位
  中国人民解放军东部战区总医院; 中国人民解放军南京军区军事医学研究所