基于综合生物信息学的宫颈癌预后模型建立

作者：金伟; 王海松; 佘冰洋; 杨浩斌; 张志强; 罗琳; 谢展鹏; 张眉^*

来源：农垦医学, 2023, 45(03): 204-211.

DOI：10.3969/j.issn.1008-1127.2023.03.003

• 宫颈癌
• 总生存率
• 长链非编码RNA(lncRNA)
• 预后模型

目的：寻找与宫颈癌预后相关的免疫相关性长链非编码RNA(long non-conding RNA,IncRNA)，构建宫颈癌预后评估模型，提高宫颈癌的生存率。方法：利用R4.2.1，采用Cox回归分析和最小绝对收缩和选择算子（lasso)Cox回归，寻找癌症基因组图谱（The Cancer Genome Atlas,TCGA）数据库中宫颈癌患者基因表达差异的长链非编码RNA(lncRNA)及生存信息差异，构建预后模型。利用R软件中“survminer”包（4.2.1版）生成Kaplan-Meier生存曲线，利用R软件中“rms”包（4.2.1版）生成列线图验证模型。结果：采用Cox回归分析和最小绝对收缩和选择算子（lasso)Cox回归模型构建免疫相关的22个lncRNA模型（包括SCP2D1.AS1、LINC00469、LINC00308、LINC00158、MIRLET7BHG、ARRDC1.AS1、SNHG32、DDC.AS1、NUP50.DT、LINC00658、LINC00629、LINC02802、LINC01281、SBF2.AS1、WWC2.AS2、USP30.AS1、IL21R.AS1、AA06、ASB16.AS1、ILF3.DT、RBAKDN、FAM27E3），预后模型预测宫颈癌患者的总生存期（HR=9.54;95%CI:6.27-14.50,P<0.01），将患者分为高、低风险组绘制K-M生存曲线，结果差异有统计学意义（P<0.01），该模型的ROC曲线的曲线下面积（AUC）为0.901，表明该模型具有良好的诊断效果。结论：本研究揭示了免疫相关的22个lncRNA模型是子宫颈癌预后预测的独立因素，可为临床上宫颈癌个体化治疗提供强有力的证据。

• 单位
  西安交通大学; 公共卫生学院; 石河子大学