微生物无处不在,并与动物机体存在着微妙的、紧密的联系。微生物与动物健康息息相关,宿主与微生物之间的相互作用关系着动物的新陈代谢、免疫稳态及神经系统等生理反应。微生物群落结构的平衡和稳定是动物代谢和健康的关键。文章介绍了微生物与疾病及环境之间关系的研究进展,并对微生物与动物疾病及环境的研究与应用前景进行了展望。