DEL cDNA序列分析及蛋白质三维结构的模建

作者：庄乃保; 张印则; 吴凡; 邵超鹏; 苏晓东

来源：国际输血及血液学杂志, 2010, 33(5): 387-390.

DOI：10.3760/cma.j.issn.1673-419X.2010.05.002

• Rh血型
• 抗-D阴性
• DEL
• cDNA
• 转录子
• 蛋白质三维结构

目的 分析DEL血型的cDNA序列,模拟并分析DEL血型蛋白质三维结构.方法 采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)技术和cDNA序列分析技术,得到DEL血型的cDNA序列并测序分析.通过同源比较模建(Homology comparative modeling)的思想,构建和分析正常阳性RHD和DEL9两种蛋白质的三维结构.结果 DEL血型个体有复杂的mRNA形式,共检测到6种形式的RhD转录子.DEL血型不存在正常的RhD mRNA.对正常RHD和与正常RHD序列相似度最高的DEL9蛋白质结构进行比较分析.结构显示DEL9蛋白属于α螺旋结构蛋白,其在膜外部分与正常RhD蛋白基本一致.结论 DEL血型可能具有正常RhD的抗原表位.

• 单位
  深圳市血液中心; 北京大学