国家自然科学基金绩效评价是我国科技计划(基金)开展绩效管理的典型模式,也是持续深化科学基金改革的重要基础。本文回顾了探索构建科学基金全面绩效评价体系的发展历程,梳理总结了科学基金绩效评价的基本方法,即基于综合视角进行评估、采取多角度证据收集思路和根据目标定位设计评价指标。提出了优化改进国家自然科学基金绩效评价的思考与建议,为新时代科学基金持续深化改革提供了参考依据。