基于共表达网络和蛋白互作分析挖掘小麦赤霉病抗性相关核心蛋白

作者：刘家俊; 陈琛; 温明星; 郭瑞; 姚维成; 李东升^*

来源：生物技术进展, 2021, 11(05): 628-633.

DOI：10.19586/j.2095-2341.2021.0117

• 小麦
• 赤霉病
• 蛋白组学
• WGCNA
• 蛋白互作

高通量蛋白组学技术能够鉴定小麦特定组织的蛋白表达水平,对小麦穗轴混池蛋白组学分析得到的632个差异表达蛋白数据进行共表达网络分析,同时筛选显著表达模块进行蛋白质互作分析,以期挖掘出与小麦赤霉病抗性相关的蛋白。WGCNA分析结果共构建了12个表达模块,其中模块6与赤霉病抗病呈极显著相关,模块8显著相关。蛋白互作网络分析筛选到7个候选蛋白,分别为参与毒素降解的GST (glutathione S-transferase)和AdoMet-MTase(S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase),参与光合作用的IM30(membrane-associated 30 Da, chloroplastic)、PnsL2(photosynthetic NDH subcomplex L 2)和PPL1(PsbP-like protein 1),以及抗逆相关的UCHL(ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase)和MetAP2(methionine aminopeptidase 2)。这些蛋白可能在赤霉病抗、感病响应中具有重要作用,值得进一步研究。

• 单位
  江苏丘陵地区镇江农业科学研究所