exoRBase数据库外泌体基因在冠心病中的差异表达及意义

作者：张楠楠; 赵明镜; 孔令旗; 张艺璇; 王尔玉; 修晟尧; 李天力; 刘小芸; 贺小芳; 常佩芬^*

来源：中国动脉硬化杂志, 2022, 30(01): 36-42.

• 冠心病
• 外泌体
• exoRBase
• 差异表达基因

目的通过对exoRBase外泌体数据库中筛选出的冠心病(CHD)患者外周血外泌体差异表达基因的分析和CeRNA网络的构建,挖掘导致冠心病发病和疾病进展中的关键基因和调控机制,通过对差异表达mRNA关键基因的GO和KEGG富集分析,研究冠心病差异表达mRNA参与的分子功能和生物学过程。方法应用R语言筛选出在exoRBase外泌体数据库冠心病患者外周血中差异表达的外泌体基因,通过在线数据库和Cytoscape软件构建CeRNA网络,对关键基因进行可视化分析,并对差异表达的mRNA关键基因进行GO和KEGG富集分析。结果筛选出冠心病患者外周血中差异表达的外泌体mRNA 312个,lncRNA 43个,circRNA 85个;通过构建CeRNA网络,发现mRNA、lncRNA和circRNA竞争性地结合miRNA,且与miRNA相结合的lncRNA表达均显著上调,而mRNA和circRNA的表达则大多数呈现显著下调的趋势;差异表达mRNA关键基因的GO和KEGG富集分析结果显示,这些关键基因主要与"磷酸酶激活活动"和"磷酸酶调节活动"功能相关。结论由exoRBase数据库筛选出的冠心病患者外周血外泌体与健康人群具有显著差异性,且mRNA、lncRNA和circRNA可以竞争性地和与冠心病显著相关的miRNA相结合,并以之实现相互调控作用。这些基因可能参与了冠心病的发生和发展,可以作为其调控点和治疗药物靶点。

• 单位
  北京中医药大学东直门医院