长非编码RNA TNRC6CAS1作为ceRNA在肥厚型心肌病发生发展中调控BPTF表达的研究

作者：匡野; 董玉琳; 吉永; 曹向红^*

来源：中国生物化学与分子生物学报, 2023, 39(01): 130-141.

DOI：10.13865/j.cnki.cjbmb.2022.12.1414

• 肥厚型心肌病
• 内源性竞争RNA网络
• 染色质重塑因子
• 长非编码RNA TNRC6CAS1
• 微RNA 30c-1-3p

肥厚型心肌病(hypertrophic cardiomyopathy, HCM)是一种以心肌细胞肥厚为特征的原发性心肌病，其发病的分子机制尚未明确。本研究整合Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中编号GSE130036和GSE36946的数据集。利用R语言对数据集中的RNA表达矩阵进行表达差异性分析。对差异mRNA进行生物功能富集分析，明确研究对象染色质重塑因子以BPTF(bromodomain PHD finger transcription factor)为核心。预测miRNA靶向mRNA和lncRNA的结合位点，构建lncRNATNRC6CAS1,miR-30c-1-3p-BPTF内源竞争RNA(ceRNA)网络。利用实时定量PCR,酶联免疫吸附测定或免疫印迹检测，在肥厚型心肌病临床样本(20例健康人和20例肥厚型心肌病患者外周血)和心肌肥大细胞模型中验证了BPTF和lncRNA TNRC6CAS1表达的明显上调(P<0.001),而miR-30c-1-3p的表达明显下调(P<0.001)。同时，在AC16细胞中对三者的表达相关性进行初步验证。最后，分别沉默BPTF,lncRNA TNRC6CAS1或过表达miR-30c-1-3p可以抑制心肌肥大标志性蛋白质的表达。以上结果表明，lncRNA TNRC6CAS1,miR-30c-1-3p,BPTF构成的ceRNA网络可能参与调控肥厚型心肌病心肌肥大病理现象的产生。三者作为潜在的肥厚型心肌病致病分子，有望成为新的检测和治疗靶点。

• 单位
  昆明医科大学