牦牛携带的产志贺毒素大肠杆菌分离株的多位点序列分型研究

作者：孙晖; 白向宁; 赵爱兰; 孟琼; 熊衍文; 卢珊

来源：中国人兽共患病学报, 2013, (12): 1137-1142.

• 产志贺毒素大肠杆菌
• 多位点序列分型
• 序列型
• 牦牛 Shiga toxin-producing Escherichia coli
• multilocus sequence typing
• sequence type
• yak

目的对牦牛携带的产志贺毒素大肠杆菌(Shiga toxin-producing Escherichia coli,STEC)进行多位点序列分型(Multilocus sequence typing,MLST)分析,了解菌株的遗传进化关系及致病潜力。方法根据E.coli MLST数据库(http://mlst.ucc.ie/mlst/dbs/Ecoli)提供的MLST方案,对青海玉树牦牛中分离的54株STEC分离株的7个管家基因进行PCR扩增并测序,通过序列比对确定其等位基因及菌株序列型(Sequence type,ST),并使用BioNumerics软件构建最小生成树(Minimum span...

• 单位
  中国疾病预防控制中心传染病预防控制所; 传染病预防控制国家重点实验室