毛竹SBP转录因子基因的全基因组鉴定和表达分析

作者：孙化雨; 杨意宏; 娄永峰; 李利超; 赵韩生; 王思宁; 高志民

来源：基因组学与应用生物学, 2017, 36(10): 4263-4274.

DOI：10.13417/j.gab.036.004263

• 毛竹
• SBP转录因子基因
• 表达模式

SBP是一类植物特有的转录因子,在调节花发育、信号转导和抗逆反应中均具有重要作用。为研究毛竹(Phyllostachys edulis)中SBP的分子特征和表达模式,开展了全基因组序列分析。结果表明,毛竹含有32个基因编码SBP转录因子,依次命名为PeSBP1PeSBP32,各基因的结构差异明显,外显子数量211个不等,其中15个SBP基因具有mi R156的结合位点。蛋白结构分析显示,PeSBPs具有2个典型的保守锌指结构域结合位点,且具有核定位信号。系统进化分析表明,32个PeSBPs隶属于8个亚类,且与水稻的亲缘关系最近。表达模式分析表明,32个PeSBPs在叶、鞭、根、20 cm笋、50 cm笋、早花期花序和晚花期花序等7个组织中的表达差异明显,呈现出不同的表达模式。本研究为深入研究毛竹SBP转录因子家族的功能提供了参考依据。

• 单位
  国际竹藤中心; 河北农业大学; 江西省林科院