计算机模拟筛选食用藻蛋白源PAR2抑制肽

作者：高立芳; 曾新安; 金可沆; 范土贵; 彭名军; 曾巧辉^*

来源：现代食品科技, 2023, 39(12): 158-168.

DOI：10.13982/j.mfst.1673-9078.2023.12.1576

• 食用藻蛋白
• 生物活性肽
• 蛋白酶激活受体2
• 分子对接

该研究主要是通过计算机模拟，从食品来源蛋白质中预测筛选具有蛋白酶激活受体2(Protease Activated Receptor 2,PAR2)抑制作用的生物活性肽，同时预测食用藻类蛋白质酶解后所得的肽段的生物活性、水溶性等理化指标。首先，利用NCBI数据库和蛋白质晶体数据库（Protein Data Bank,PDB）比对选择食用藻类蛋白质，其次通过BIOPEP-UWM数据库模拟酶解，Peptide Ranker进行活性分析，Innovagen和Toxin Pred预测高活性肽，最后采用HPEPDOCK将获得的活性评分超过0.5、水溶性优且无毒的小分子活性肽与PAR2进行分子对接模拟，以探究两者之间的分子结合能力，进而分析判别不同小分子活性肽抑制PAR2活力的潜力和机制。结果表明，小分子寡肽PAGR(-165.80)、PAR(-163.93)、IDQW(-152.95)、DISAW(-154.48)与PAR2具有较高的结合分数，是PAR2潜在的活性抑制肽。该研究旨为藻类蛋白的开发利用以及PAR2抑制剂的挖掘研究提供参考。

• 单位
  佛山科学技术学院; 广州市食品检验所