基于数据挖掘分析LUM基因在胃癌中的表达及意义

作者：彭帅; 田敏秀; 王珊珊; 李慧敏; 沈磊^*

来源：肿瘤预防与治疗, 2020, 33(07): 561-566.

• 胃癌
• LUM
• 数据挖掘
• Oncomine
• UALCAN

目的:通过数据库分析LUM基因在胃癌中的表达情况及意义。方法:通过Oncomine数据库分析LUM基因在胃癌中的差异性表达,基于GEPIA网站分析LUM基因表达与胃癌患者生存周期的关系;同时利用MethHC数据库分析LUM基因甲基化水平,使用基于TCGA数据集的UALCAN在线数据库对LUM在胃癌患者中的表达及预后进行验证;并通过String数据库分析LUM基因的蛋白相互作用及上下游调控关系。结果:胃癌组织中LUM的mRNA表达较正常对照组明显增高;Meta分析进一步证实LUM基因的表达在胃癌组织中明显增高。GEPIA分析发现高表达组患者生存周期明显短于低表达组(P<0.05)。与此同时,甲基化分析中得出LUM基因甲基化水平肿瘤组明显高于正常组;TCGA数据集验证显示LUM在胃癌组织中的表达量与预后有关;蛋白质网络分析得出,LUM可能与OGN、CHST1、CHST5、CHST6、DCN、COL1A1、COL1A2、COL3A1、COL4A2、ACAN等蛋白相互作用。结论:基于多个数据库的数据挖掘发现,LUM基因在胃癌组织中呈现高表达,且其表达水平与胃癌患者总体生存相关;LUM是与胃癌预后相关的生物标志物,参与肿瘤的发生发展,或可作为诊断和治疗的潜在靶点。

• 单位
  武汉大学人民医院