在创新质量差异化视角下,以2016年截面数据为样本,应用三阶段DEA模型,对我国医药制造行业创新效率进行再评价。研究发现,(1)引入质量系数后,三阶段DEA模型刻画和解释现实的能力显著提升;(2)环境因素虚高了创新效率值,置于同质经营环境时,纯技术效率不高的问题更为突出;(3)作为环境因素,工业基础对制药业创新效率有显著正向影响,而政府支持和制药企业规模却未表现出明显的促进作用。