基于网络药理学和分子对接探讨常见酚酸提高机体免疫力的作用机制

作者:张宇欣; 刘魏魏; 杨娟; 周炜炜; 戴小枫; 李秀梅*; 郑威*
来源:食品工业科技, 2023, 44(02): 29-40.
DOI:10.13386/j.issn1002-0306.2022030227

摘要

目的:运用网络药理学和分子对接研究常见酚酸类化合物提高机体免疫力的分子机制。方法:利用TCMSP数据库、STITCH数据库、SwissTargetPrediction在线靶点筛选平台收集常见酚酸类化合物潜在靶点,并利用Cytoscape3.8.0软件构建酚酸类化合物-靶点网络图。在GeneCard数据库、OMIM数据库收集免疫力相关靶点,与常见酚酸类化合物靶点取交集并导入STRING数据库进行蛋白质与蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)分析,得到酚酸类化合物提高免疫力的核心作用靶点,将核心靶点导入DAVID数据库进行GO功能富集及KEGG通路富集。最后,应用AutoDock软件对关键成分与关键靶点进行分子对接验证。结果:共收集到常见酚酸类化合物36个,对应靶点496个,提高免疫力靶点16691个,二者取交集,获得酚酸类化合物增强免疫作用靶点454个,其中关键作用的靶点为SRC、MAPK1、HSP90AA1、AKT1、TP53等,发挥作用的主要成分为迷迭香酸、迷迭香酸甲酯、鞣花酸、阿魏酸乙酯、芥子酸等。GO及KEGG分析结果显示,常见酚酸类化合物通过调控正调控RNA聚合酶II启动子转录、转录的正调控,DNA模板化、凋亡过程的负调节等生物过程,通过癌症通路、多聚糖肿瘤通路、MAPK信号通路等多条通路发挥增强免疫作用。分子对接结果表明,关键化合物与靶点分子对接结果良好,验证了网络药理学预测结果的准确性。结论:本研究揭示常见酚酸类化合物通过调控多靶点、多途径发挥增强机体免疫力的作用,为酚酸类化合物的开发及进一步研究奠定基础。

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