西藏高原人群铁调素基因hamp密码子偏好性分析

作者：施静; 雷鸣; 张勇群^*; 孙舒遥; 李明霞; 孙曾梅; 邬云红

来源：现代生物医学进展, 2018, 18(21): 4027-4050.

DOI：10.13241/j.cnki.pmb.2018.21.006

• 西藏高原人群
• 铁调素基因
• 密码子偏好性

目的:通过对西藏高原人群及平原人群、恒河猴等其他5种物种的密码子使用进行分析,从而得出西藏高原人群铁调素基因(hamp)的密码子偏好性。方法:采用PCR技术获得西藏高原人群铁调素全基因序列,利用在线软件CodonW进行密码子偏好性分析,通过在线软件PredictProtein以及Signal P等软件进行西藏高原人群铁调素基因的结构分析,比较与GenBank数据库中选取的平原人群、恒河猴等其他5种物种的密码子偏好性的差异。结果:西藏高原人群的铁调素基因全长为2681 bp,由3个外显子和2个内含子组成,编码84个氨基酸的铁调素前体肽,包含信号肽、中间肽与成熟肽,其密码子偏好性与平原人群、恒河猴等其他5个物种的密码子偏好性均有不同程度的差异。结论:西藏高原人群铁调素基因hamp密码子偏好性与其他物种的密码子偏好性均有不同程度的差异。

• 单位
  西藏大学; 西藏自治区人民政府驻成都办事处医院