栽培花生Aux/IAA家族鉴定与生物信息学分析

作者：方月哏旺; 张晓嘉; 何华; 胡华斌^*; 陈江华^*

来源：分子植物育种, 2020, 18(10): 3115-3125.

DOI：10.13271/j.mpb.018.003115

• 栽培花生
• Aux/IAA
• 聚类分析
• 表达模式

Aux/IAA (Auxin/Indole-3-Acetic Acid)家族是生长素(Auxin)信号的早期响应基因家族之一,广泛参与调控植物的生长发育。然而目前对于栽培花生(Arachis hypogaea) Aux/IAA家族的研究还未见相关报道。本研究在栽培花生中共鉴定到了34个Aux/IAA基因,分布在15条不同的染色上。多重序列比对分析发现花生Aux/IAAs具有4个保守结构域,分别为Ⅰ-Ⅳ。聚类分析将花生Aux/IAAs分为Ⅰ-Ⅷ,8个亚家族。各个亚家族内部基因具有相似的保守基序,而基因之间的内含子/外显子结构存在差异。基于基因表达模式分析将栽培花生分为A和B两组基因,A组基因在花生各个组织的表达量都相对较高,而B组基因的表达具有组织特异性。基于以上结果,本研究将为进一步对Aux/IAA家族的基因功能研究提供科学依据。

• 单位
  中国科学院西双版纳热带植物园; 中国科学院大学