猪T细胞受体β链基因的克隆及生物信息学分析

作者：李玩生; 刘磊; 冯海燕; 房永祥; 景志忠

来源：甘肃农业大学学报, 2010, (03): 1-6+13.

DOI：10.13432/j.cnki.jgsau.2010.03.023

• 猪TCR-β链基因
• 基因克隆
• 生物信息学
• 结构预测 porcine T cell receptor beta chain gene
• gene cloning
• bioinformatics
• structure prediction

以GenBank上登载的猪的T细胞受体β(pTCR-β)基因为参考序列,用RT-PCR法从猪的外周血淋巴细胞中克隆了TCR-β链基因,并进行生物信息学分析.结果表明:pTCR-β基因含有一个完整的开放阅读框架(ORF),大小为849bp,编码283个氨基酸,且含有一段27个氨基酸的信号肽序列,与参考序列相比,在核苷酸序列上的同源性为80.4%,在氨基酸序列上的同源性为70.3%;生物信息学结构预测发现2个结构域,一个为IG结构域,由第32-138位共107个氨基酸残基组成;另一个为IG-LIKE结构域,由第164-211位共48个氨基酸残基组成.

• 单位
  家畜疫病病原生物学国家重点实验室; 甘肃农业大学; 中国农业科学院兰州兽医研究所