手足口病柯萨奇病毒A10和A6型的分子鉴定及其VP1区3′端序列分析

作者：任倩; 张乐海; 马丽霞; 王世富; 吕欣; 张忠; 于爱莲

来源：中国病原生物学杂志, 2011, (08): 561-564+570.

DOI：10.13350/j.cjpb.2011.08.001

• 手足口病
• 柯萨奇病毒A10型
• 柯萨奇病毒A6型
• VP1区域
• 基因序列分析 Hand
• foot
• and mouth disease
• Coxsackievirus A10
• Coxsackievirus A6
• VP1 region
• sequence analysis

目的鉴定手足口病患儿咽拭子病原体柯萨奇病毒A10(CVA10)和A6(CVA6),并对其VP1编码区3′端序列进行分析。方法合成对肠道病毒VP1区3′端序列具有较高特异性的兼并引物040-011,RT-PCR方法测定其VP1区3′端基因序列,通过BLAST程序比对,鉴定病毒的基因型;与GenBank中其他已知病毒基因型序列进行同源性分析,构建遗传进化树。结果 38例非EV71非CVA16引起的手足口病患儿咽拭子,5例检测到CVA10,1例检测到CVA6。在进化关系上CVA10与D基因型最为密切,核苷酸和氨基酸同源性分别为92.7%~94.2%、91.7%~100%;CVA6与2003~2009...

• 单位
  山东第一医科大学; 山东大学齐鲁儿童医院