太行鸡FST基因克隆、序列特征及表达分析

作者:张贝贝; 李梦霄; 马腾壑*; 李雪男; 魏佳荣; 康国磊; 王红娜; 刘超; 王斌; 孙研研*
来源:畜牧兽医学报, 2021, 52(11): 3064-3075.

摘要

旨在基于生物信息学方法分析太行鸡卵泡抑素基因(follistatin,FST),并研究其在不同组织及卵泡不同发育时期表达差异,解析FST对太行鸡产蛋性能的影响。本研究使用RT-PCR对43周龄健康太行鸡FST基因编码区序列进行克隆和测序,运用生物信息学软件对其功能结构进行预测,荧光定量PCR技术对43周龄健康麻羽太行鸡FST在不同组织及不同发育时期卵泡中的表达差异进行分析,每组设3个重复,进行3次平行试验。结果显示,太行鸡FST基因编码区为1 032 bp,编码343个氨基酸,太行鸡FST蛋白与日原鸡同源性最高(100.0%),存在Sec信号肽,成熟蛋白具有FOLN和KAZALFS 2个保守结构域。该蛋白为亲水蛋白,蛋白分子式为C1619H2567N459O520S44,分子量为38.192 6 ku,理论等电点为5.59,其中含量最高的是Cys (C),为10.50%;蛋白质二级结构含有α-螺旋、延伸链、β转角、无规卷曲,占比分别为16.33%、16.62%、5.25%、61.81%。FST基因在不同组织中均有表达,在肝中表达量最高。FST基因在各级卵泡表达量存在差异,其中,在大白卵泡中表达量最高(P<0.01),在卵泡选择前后表达量存在1.6倍表达差异。上述结果为研究太行鸡FST基因结构和功能提供了重要的基础数据,也为进一步挖掘太行鸡产蛋性能候选高产基因提供了参考。