郏县红牛生长发育性状全基因组关联分析

作者：陈付英; 牛晖; 施巧婷; 滑留帅; 冯亚杰; 徐照学; 王二耀^*

来源：中国牛业科学, 2018, 44(05): 24-28.

• 郏县红牛
• 生长性状
• SLAF-seq
• 全基因组关联分析
• 候选基因

本研究的目的是分析郏县红牛生长性状遗传基础,筛选与生长性状相关的候选基因。运用SLAF-seq简化测序技术,通过全基因组关联分析,筛选出3个与郏县红牛生长性状相关的SNP位点,rs449748996位点与18月龄体高显著相关(P=9.88E-13),rs210024569与6月龄体高潜在显著相关(P=9.53E-08),rs42177491与12月龄胸围潜在显著相关(P=2.71E-07)。在每个SNP周围1Mb区域内筛选相关基因,并对之进行GO数据库分析,发现rs449748996位点所在的LOC100337124基因可以作为18月龄体高性状的候选基因;rs210024569位点所在的C6orf106基因可以作为6月龄体高性状的候选基因;rs42177491位点所在的JAM3基因能否作为12月龄胸围的候选基因还需要进一步验证。

• 单位
  河南牧业经济学院; 河南省农业科学院