新型冠状病毒3CL水解酶的结构特征及其抗原表位分析

作者：王道^*; 彭亮

来源：生命科学研究, 2020, 24(05): 345-366.

DOI：10.16605/j.cnki.1007-7847.2020.05.001

• 新型冠状病毒(SARS-CoV-2)
• 3CL水解酶
• 抗原表位
• 生物信息学

新型冠状病毒(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2, SARS-CoV-2)含有的3CLpro(3C-like protease)是由306个氨基酸构成的亲水性蛋白酶。3CLpro序列在冠状病毒中高度保守,对SARS-CoV-2的正常功能至关重要。为了深入了解3CL水解酶的结构特征及其抗原表位,本研究利用多种生物信息学软件分析了该酶的理化性质、亲/疏水性、跨膜区、糖基化位点、磷酸化位点、SUMO化位点、二级结构和结构域、配体结合位点及B/T细胞的优势抗原表位,结果发现3CLpro不存在跨膜区,并推测含有糖基化位点2个、磷酸化位点27个、SUMO化位点3个; 3CLpro的二级结构以α-螺旋和β-折叠为主,结构域包含一个endopeptidase/C30保守序列;3CLpro存在5个可能的配体结合位点和多个潜在的B/T细胞表位。此外, DrugBank数据库还预测到8个潜在的小分子药物。综上所述,本研究为新型冠状病毒肺炎(coronavirusdisease 2019, COVID-19)的药物和疫苗研制提供了理论基础。

• 单位
  中南大学湘雅二医院