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摘要
目的 对一起新型冠状病毒（SARS-CoV-2）奥密克戎（Omicron）变异株引起的疫情感染者咽拭子样本进行全基因组测序分析，为新冠病毒感染疫情防控提供参考依据。方法 利用高通量测序技术对2022年4月山东省某县级市4例SARS-CoV-2感染者咽拭子样本进行全基因组测序，利用MEGA 7.0.14软件分析病毒同源性并构建进化树、分析变异位点等。结果 4条SARS-CoV-2全基因组序列与参考株wuhan-hu-1相比同源性为99.76%～99.77%，在进化树上均位于奥密克戎BA.2进化分支；均发生多个基因位点变异和缺失，其中，A28271T变异致使N翻译起始区的–3位核苷酸由A变异为T;S蛋白LPP24-26缺失致使双色氨酸（WW）结构域的潜在结合基序PPAY25-28丢失。结论 Omicron变异株出现大量变异位点，这些变异位点或与Omicron变异株传染性强、隐匿性高、引起临床严重程度低有一定关系。
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单位济宁市疾病预防控制中心
