亚洲带绦虫成虫谷胱甘肽S-转移酶基因的克隆及生物信息学分析

作者：黄江; 胡旭初; 徐劲; 黄艳; 余新炳; 包怀恩; 郎书源; 廖兴江

来源：中国人兽共患病学报, 2007, 23(11): 1093-1096+1100.

DOI：10.3969/j.issn.1002-2694.2007.11.007

• 亚洲带绦虫
• 谷胱甘肽S-转移酶
• cDNA
• 生物信息学

目的分析亚洲带绦虫成虫谷胱甘肽S-转移酶(GST,glutathione S-transferase)基因结构并预测其编码蛋白的结构和功能。方法利用生物信息网站如美国国家生物技术信息中心(NCBI,http://www.ncbi.nl m.nih.gov/)和瑞士生物信息学研究所的蛋白分析专家系统(ExPASY,http://ca.expasy.org/)中生物信息学分析工具,并结合其它分析软件,从获得亚洲带绦虫成虫全长cDNA质粒文库的表达序列标签(EST,expression sequence tag)中识别GST基因,分析该基因的结构并预测其编码的蛋白质的结构和功能特征。结果该基因与猪带绦虫GST的一致性为94%,相似性为97%;全长810bp,编码区为28~687bp,编码219个氨基酸,无各种亚细胞定位序列,具有多个潜在的磷酸化位点,蛋白的理化性质稳定;预测三个主要的抗原表位89aa~94aa,27aa~32aa,119aa~124aa位于空间结构上相距较远的分子表面,前面两个表位属于绦虫共有的线性抗原表位。结论从亚洲带绦虫成虫cDNA文库中筛选出GST基因,预测为胞浆型蛋白,可能具有较好的免疫诊断抗原应用前景。

• 单位
  中山大学中山医学院; 贵州医科大学