基于QRSCU方法的RHD基因的偏好性研究及其应用

作者：齐斌; 赵静静; 高雷; 朱平

来源：计算机与应用化学, 2011, (04): 415-418.

DOI：10.16866/j.com.app.chem2011.04.008

• RHD基因
• 拟氨基酸
• 同义密码子
• 偏好性 RHD gene
• quasi-amino acids
• synonymous codon
• preference

Rh血型系统作为人类最复杂的血型系统之一,其临床意义仅次于ABO血型系统。研究人类Rh血型系统中RHD基因对同义密码子的使用偏好性有助于从生物信息学角度了解RHD基因的编码特征。本文基于拟氨基酸编码方法,计算了人类Rh血型系统中RHD基因的同义密码子的相对使用度(quasi relative synonymous codon usage,QRSCU)及4种碱基分别出现在密码子3'端的相对频率(quasi relative frequency of nucleotide to codon3',QRFN3')。通过分析计算结果中RHD基因的QRSCU值,得出RHD基因偏好使用以C或G结尾的同义密码...

• 单位
  无锡职业技术学院; 江南大学