儿童骨肉瘤中TP53突变与免疫分子基因表达的相关性分析

作者：郭梅; 李渝华; 荆安龙^*

来源：现代肿瘤医学, 2022, 30(15): 2837-2841.

• 骨肉瘤
• TP53
• 突变
• 免疫评分
• 免疫检查点

目的:筛选儿童骨肉瘤中突变基因，并研究其表达与免疫反应的关系。方法:从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)下载全部234例骨肉瘤病例数据集，从基因表达数据库(Gene Expression Omnibus, GEO)下载数据集GSE36001(19个肿瘤样本和6个正常样品)和GSE39055(37例肿瘤样本和12个正常样本),包括基因突变数据、转录组数据和临床数据，进行生物信息学分析。收集11例骨肉瘤手术样本，实时荧光定量PCR验证临床样本中基因表达。结果:67.09%的骨肉瘤患者存在突变，其中错义突变、单核苷酸变异和C>T突变较多，突变基因排在前10位的分别为TP53、TTN、ATRX、MUC16、RB1、PCLO、RYR2、CSMD1、USH2A、MUC17。在数据集GSE36001和GSE39055中，骨肉瘤组织中TP53均过表达(P<0.000 1)。在11例病例样本中，骨肉瘤组织中TP53表达高于正常组织(P=0.002)。TCGA中，TP53突变型表达高于TP53野生型(P=0.015)。在11例病例样本中，TP53突变型表达高于TP53野生型(P=0.038)。TCGA中，突变型TP53表达与DNA甲基化呈显著负相关(P=0.003)。在TP53突变的骨肉瘤样本中，B细胞、T细胞CD8+相关的免疫应答显著下调，CD274和CTLA4显著高表达(P<0.05)。结论:TP53突变与骨肉瘤的发生及免疫反应密切相关，有望成为骨肉瘤诊断和治疗的作用靶点。

• 单位
  重庆市合川区人民医院