高性价比寡核苷酸基因表达谱芯片的制备方法

作者：任永红; 张科; 孙清岚; 王亚辉; 庄远红; 张亮

来源：中国医药生物技术, 2010, (01): 38-43.

• 寡核苷酸序列分析
• 寡核苷酸探针
• 基因表达谱 DNAmicroarray
• Oligonucleotide probes
• Gene expression profiling

目的探讨探针长度对寡核苷酸(Oligo)基因芯片杂交信号的影响。方法以大肠杆菌基因表达信息作为实验模型,根据已有大肠杆菌全基因组芯片数据选择覆盖高、中、低杂交信号强度的20个大肠杆菌基因,针对该20个基因分别设计59-mer和70-mer长度Oligo探针,并将2种探针点制在同一张芯片中,同时设阳性对照探针和阴性对照点样液。提取大肠杆菌RNA,经过反转录、扩增、荧光标记后与芯片进行杂交反应,采用激光共聚焦扫描仪扫描芯片,利用数据分析软件提取探针的杂交信号值并进行显著性分析。结果大肠杆菌28SrRNA和18SrRNA条带清晰,无降解带出现,质量合格。芯片杂交结果显示59-mer和70-mer长度...

• 单位
  湖南第一师范学院; 生物芯片北京国家工程研究中心; 博奥生物有限公司