由于细胞之间存在异质性,单细胞水平的代谢物分析可为复杂生物系统的研究提供更丰富的信息。微流控系统可在微米级结构内对流体进行操纵,其微结构尺度与细胞大小接近,非常适合进行单细胞分析。本文对基于微流控系统的单细胞代谢物分析技术的进展进行了综述,根据分析中所采用检测方法的不同,分别详细介绍了基于荧光显微成像、激光诱导荧光、电化学、质谱、化学发光和传感检测技术的微流控单细胞代谢物分析系统及其应用研究。