基于不同引物的湖泊沉积物中细菌群落结构多样性的比较研究

作者：赵兴青; 杨柳燕; 陈灿; 于振洋; 彭乃莹; 肖琳; 尹大强

来源：南京大学学报(自然科学版), 2008, (03): 289-296.

• 沉积物
• 细菌多样性
• 变性梯度凝胶电泳(DGGE)
• 16S rDNA
• 通用引物 lake sediment
• the bacterial diversity
• denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE)
• universal primers

采用PCR-DGGE技术,用两对引物对湖泊沉积物细菌群落结构进行了比较研究.结果表明:沉积物样品中细菌群落结构显示了明显的空间分布多样性差异,随着沉积深度的增加,细菌群落多样性指数降低.采用不同引物扩增的产物DGGE图谱聚类相近,均分成0~20 cm和20~45 cm两大类,但引物341f/534r得出的相似性Cs值在30.2%~75.9%之间,引物341f/926r得出的相似性Cs值在34.3%~84.1%之间,采用不同引物不同沉积深度样品群落结构之间的相似性和优势种动态变化存在差异.

• 单位
  污染控制与资源化研究国家重点实验室; 南京大学