普通烟草YUCCA基因家族的生物信息学分析

作者：王仁汉; 宋志美; 屈旭; 刘少云; 李毅君^*

来源：江苏农业科学, 2021, 49(03): 61-65.

DOI：10.15889/j.issn.1002-1302.2021.03.010

• 烟草
• YUCCA基因家族
• 生物信息学
• 生长素

YUC基因家族催化吲哚-3-丙酮酸(IPA)生成生长素(IAA)的过程,进而调控植物生长素的合成。目前,研究者已经在多种植物上鉴定分析了YUCCA基因家族,但是关于烟草中该基因的报道较少。为了探讨普通烟草YUCCA基因结构及功能,通过检索普通烟草全基因组蛋白序列,筛选出21个烟草YUCCA基因家族序列,利用生物信息学工具对其蛋白质结构域、亚细胞定位、同源性进行分析。系统发育树分析结果显示,烟草YUCCA蛋白可以聚类到4个分支,与同为单子叶植物的拟南芥的亲缘关系较近。结构域分析结果显示,烟草YUCCA基因内含子数量在0～6个之间;协同进化树分析结果显示,亲缘关系近的基因内含子数量较为相近;亚细胞定位结果显示,19个序列定位到细胞质,2个序列定位到细胞质膜,该基因可能参与细胞质基因的转录调控。

• 单位
  中国农业科学院烟草研究所