随着我国医疗卫生体制不断发展完善,乡镇卫生院作为医疗体系中的重要组成部分,对其财务管理水平提出了更高的要求。为贯彻落实国家卫计委《关于规范基层医疗卫生机构实行财务集中核算的意见》,加快推进乡镇卫生院会计集中核算成为重点内容。在此背景下,提高乡镇卫生院会计集中核算内部控制水平为其发展提供重要保障。本文主要分析了乡镇卫生院会计集中核算内部控制存在的问题,并提出了有效建议以提高其内部控制水平,为乡镇卫生院健康稳定发展提供一定的参考。