不结球白菜Ty1-copia类逆转座子序列的克隆及表达

作者：肖栋; 侯喜林; 马景蕃; 王枫; 齐莉; 李音孜

来源：西北植物学报, 2009, (04): 643-649.

• 不结球白菜
• Ty1-copia类逆转座子
• 逆转录酶
• 异质性
• 活性分析 Brassica campestris ssp.chinensis
• Ty1-copia-like retrotransposons
• reverse transcriptase
• heterogeneity
• experssion analysis

参照Ty1-copia类逆转座子逆转录酶的保守区设计简并引物,分别从10个不结球白菜(Brassica campes-trisssp.chinensis)品种的全基因组中均扩增出260 bp左右的目标条带。将目的条带回收、克隆和测序后进行分析,DNAstar分析发现,这些序列存在高度的异质性,28个核苷酸序列变化范围为224~278 bp,同源性范围为16.7%~83.0%。28条序列通过核苷酸聚类分为8个家族。推导氨基酸序列有移框突变、终止子突变或二者兼有;与已登录的不同物种同一类型逆转录酶氨基酸系统进化树分析表明,不结球白菜Ty1-copia类逆转座子与芥菜型油菜、拟南芥、芜菁、甜菜可能有...

• 单位
  农业部; 作物遗传与种质创新国家重点实验室; 南京农业大学