棉花作为重要的经济作物和纺织原料在中国纺织业中的战略地位十分重要。新疆作为中国重要的棉花主产区,面对日益趋紧的资源约束瓶颈如何保障其棉花的生产效率关系到中国棉花产业的发展。在探讨中国棉花生产成本变动的基础上,通过DEA模型和Tobit模型分析了新疆棉花生产要素的生产效率,探析了影响当地棉花生产效率的主要因素,指出了当地棉花生产中存在的主要问题。最后,围绕新疆棉花产业健康稳定发展,从适度规模经营降低成本、多模式发展稳定棉农收益、加快农业机械化发展等方面提出了政策建议。