基于网络药理学与分子对接探索人参-五味子配伍治疗特发性肺间质纤维化的分子机制

作者：顾一丹; 任允琰; 章朱峰; 高平^*

来源：山东科学, 2022, 35(01): 28-36.

• 人参
• 五味子
• 特发性肺间质纤维化
• 网络药理学
• 分子对接

基于网络药理学与分子对接方法,探讨中药人参-五味子配伍治疗特发性肺间质纤维化(idiopathic pulmonary fibrosis, IPF)的潜在分子机制。通过GeneCards、CTD、GEO等数据库预测IPF疾病靶标基因,从TCMSP平台筛选人参-五味子有效活性成分及其治疗靶标,构建中药-活性成分-靶标基因调控网络。通过STRING网站分析靶标基因蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction, PPI)关系并筛选出其中的关键基因;通过SwissDock在线平台进行关键靶标与有效活性成分的分子对接,验证评估其结合潜力;利用R语言进行关键基因的基因本体(gene ontology, GO)功能注释与基于京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)信号通路富集分析。结果表明:共筛选获得人参-五味子含山奈酚、豆甾醇等23个有效活性成分,作用于48个IPF靶标基因,并从靶标基因PPI网络中筛选获得AKT1、PTGS2、IL1B等20个关键基因,关键基因与药对活性成分分子对接能量稳定,结合牢固;关键基因主要富集于核受体活性、类固醇受体活性等67个GO生物学过程,以及白介素17信号通路、肿瘤坏死因子TNF信号通路等90个KEGG信号通路。人参-五味子配伍益气养阴,其可能通过调节机体免疫、抗纤维化、抗氧化应激、抑制炎症等多通路机制发挥治疗IPF的作用。