谷子GRF基因家族鉴定与分析

作者：张立全; 张浩林; 李丛丛; 姚磊; 魏建华; 张杰伟

来源：西南农业学报, 2021, 34(11): 2340-2347.

DOI：10.16213/j.cnki.scjas.2021.11.005

• 谷子
• GRF
• 基因家族
• 进化分析
• 磷酸化

【目的】系统分析谷子GRF基因家族在谷子中如何发挥作用。【方法】基于谷子基因组数据库和生物信息学方法,鉴定谷子GRF基因家族的基因结构、基本特征、编码蛋白结构和潜在的磷酸化位点,并以序列比对进行系统进化分析。【结果】谷子含有10个GRF基因,含有2～4个外显子,分布于谷子第1、2、4、7、8和9号染色体上。MEME保守基序分析显示,谷子GRF蛋白均含有保守的QLQ(PF08880)和WRC(PF08879)结构域。磷酸化位点分析表明谷子GRF蛋白均含有大量的潜在磷酸化位点。【结论】为今后揭示谷子GRF蛋白的功能及其翻译后修饰提供重要参考。

• 单位
  生命科学学院; 北京市农林科学院; 上海师范大学