鸟分枝杆菌MAV＿2043基因编码蛋白的生物信息学分析

作者：陈瑞枫; 马枫茜; 李祥芳; 丁寿鹏; 高婧华; 吴利先^*

来源：中国病原生物学杂志, 2022, 17(08): 907-911.

DOI：10.13350/j.cjpb.220808

• 鸟分枝杆菌
• MAV＿2043
• [Cu-Zn]超氧化物歧化酶
• 生物信息学

目的 预测鸟分枝杆菌MAV＿2043基因编码蛋白的结构和功能。方法 利用UniproKB数据库、PredictProtein服务、SWISS-MODEL服务、ProtParam蛋白分析工具、Protcale、TMHMM-2.0服务和SignalP-5.0服务、ProtCompB方法和IEDB数据库等生物信息学预测软件对MAV＿2043编码蛋白的二级和三级结构、理化性质、疏水性分析、信号肽、跨膜区、亚细胞定位及免疫表位进行分析预测；运用UniprotKB数据库的Blast工具对氨基酸序列进行比对，采用MEGA11软件构建进化树，进行系统进化分析。结果 MAV＿2043基因全长618 bp,共编码205个氨基酸。MAV＿2043基因编码蛋白与鸟分枝杆菌亚种起源相同，该蛋白与结核分枝杆菌的[Cu-Zn]超氧化物歧化酶同源性较高。该蛋白为稳定的亲水性蛋白，无跨膜区、有信号肽；预测该蛋白亚细胞定位在细胞膜上，二级结构以β折叠为主；三级结构模型显示该蛋白可形成同源二聚体，有两个Cu+配体的结合空间位置。结论 生物信息学预测鸟分枝杆菌MAV＿2043基因编码蛋白可能为[Cu-Zn]超氧化物歧化酶，是鸟分枝杆菌中的重要毒力因子，可为鸟分枝杆菌靶向治疗提供新思路。

• 单位
  大理大学; 基础医学院