苜蓿根腐病根内细菌的群落结构及多样性

作者：孙红霞; 史志丹; 房永雨; 郝丽芬^*; 李子钦^*

来源：中国草地学报, 2023, 45(12): 80-88.

DOI：10.16742/j.zgcdxb.20220366

• 苜蓿
• 根腐病
• 根内细菌
• 群落结构
• 多样性

为探讨苜蓿根中细菌群落结构与根腐病的关系，采用高通量测序技术，对采自内蒙古自治区呼伦贝尔市、赤峰市和呼和浩特市的苜蓿根腐病病根中的细菌群落结构和多样性进行分析。结果如下：（1）Alpha多样性分析表明，苜蓿健康根中细菌的Observed＿species指数和Chao 1指数显著高于苜蓿病根（P<0.05）,Shannon和Simpson指数差异不显著。（2）PCoA分析发现，病原菌侵染不同程度地改变了原有群落的结构，且根腐病是造成苜蓿根中细菌群落改变的主要因素，地理位置是次要因素。（3）苜蓿根腐病根中拟杆菌门（Bacteroidetes）和厚壁菌门（Firmicutes）细菌的相对丰度明显升高，放线菌门（Actinobacteria）和蓝藻门（Cyanobacteria）的相对丰度明显降低；苜蓿病根（除呼和浩特市托克托县样品外）中黄杆菌属（Flavobacterium）、假单胞菌属（Pseudomonas）、根瘤菌属（AllorhizobiumNeorhizobium-Pararhizobium-Rhizobium）相对丰度升高，放线菌属（Actinoplanes）和新鞘脂菌属（Novosphingobium）相对丰度下降。综上所述，苜蓿发生根腐病后，根中细菌群落结构和多样性发生了显著变化，黄杆菌属、假单胞菌属、根瘤菌属在病根中被显著富集，可作为生防菌候选菌群。

• 单位
  内蒙古自治区农牧业科学院; 中国农业科学院草原研究所; 生命科学学院; 内蒙古大学