马铃薯转录因子StWRKY6基因克隆及其生物信息学的分析

作者：田佩耕; 田再民^*; 龚学臣; 张云帅; 翟鑫娜; 刘毅强; 冯琰; 王宽; 王培玉

来源：分子植物育种, 2023, 21(22): 7318-7324.

DOI：10.13271/j.mpb.021.007318

• 马铃薯
• WRKY转录因子
• StWRKY6
• 生物信息学分析

WRKY转录因子是目前研究的与逆境有关的转录因子之一。本试验以马铃薯栽培品种‘冀张薯12号’为材料，获得StWRKY6基因，并对其进行了生物信息学分析和功能的初步研究。StWRKY6基因长度为1 491 bp，由496个氨基酸编码而成，其相对分子量为55 212.93，理论等电点为7.02，带负电残基总数为48，带正电残基总数为47，不稳定系数为51.70。该蛋白质二级结构以无规则卷曲为主，占54.9%,α-螺旋为32.3%，延伸链为9.7%,β-折叠为3.2%，是不稳定蛋白，属于亲水蛋白。通过进化树分析，与番茄同源性最高，可达90%以上；利用RT-qPCR构建表达谱，发现StWRKY6在叶片中的表达量较高；经过低温胁迫和盐胁迫处理一定时间后其表达量显著增加，说明其可能与马铃薯的耐盐性和耐低温性有关。本研究为深入研究马铃薯StWRKY转录因子参与非生物胁迫调控提供科学依据。

• 单位
  河北北方学院