作为目前全球第二大传染病,结核病的诊断、控制及耐药问题是最具挑战性的问题之一,而耐药菌株,尤其是耐多药菌株对于结核病的防控及治疗尤为重要。以宏基因组学为基础的二代测序技术从基因组层面为结核分枝杆菌的鉴定提供了重要方法。本文从结核病流行病学、结核分枝杆菌耐药及相关生物信息学等角度出发,介绍了宏基因组二代测序技术在结核分枝杆菌鉴定中的应用进展。