摘要
目的采用网络药理学的原理和方法探讨牛膝治疗骨关节炎(osteoarthritis,OA)的物质基础和作用机制。方法先通过TCMSP、Batman-TCM、DrugBank数据库及手工检索获得牛膝活性成分及作用靶点,然后与从Drugbank等6个数据库挖掘的骨关节炎疾病靶点匹配,经Cytoscape软件构建网络、拓扑学分析,再分别用ClueGO和R软件包clusterProfiler对关键靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析,最后采用AutoDock 4.2和PyRx软件对活性成分和主要核心靶点进行分子对接。结果获得22个牛膝潜在活性成分和203个靶蛋白,收集到205个骨关节炎疾病靶点,得到29个牛膝治疗骨关节炎的关键靶点。GO功能和KEGG通路富集结果显示,牛膝治疗骨关节炎涉及趋化因子代谢、吞噬作用调节等多个生物过程,以及涉及软骨细胞增殖、分化、凋亡及炎症反应等多条通路。分子对接结果提示牛膝治疗骨关节炎的活性成分与核心靶点IL6、PTGS2、VEGFA、TNF、TP53有良好的亲和力。结论牛膝治疗骨关节炎具有多靶点、多通路的特点。牛膝可能通过多条通路直接或者间接影响骨关节炎的发生和发展,与目前牛膝治疗骨关节炎的机制研究相符。
- 单位