苹果小G蛋白MdoROP的进化分类、结构及理化特性分析

作者：刘礼瑶; 何璐; 赵博; 熊仁次^*; 杨叔青^*

来源：生物技术, 2023, 1-12.

DOI：10.16519/j.cnki.1004-311x.2023.06.0200

• 苹果
• 小G蛋白MdoROP
• 系统进化关系
• 理化特性
• 蛋白结构

[目的]获取6个MdoROP蛋白并对其基序组成、系统进化关系、蛋白结构及理化特性进行分析。[方法]取苹果叶片进行离体接菌,利用SMARTS和MEGA 11等多种生物信息学软件对其进行预测分析。[结果]基于蛋白基序的组成差异可将MdoROP蛋白归为同一类且均无特异性基座,表明以上6个motif为6个MdoROP蛋白的保守基序。MdoROP蛋白长度介于197～211 aa之间;脂肪指数介于87.24～92.56之间;蛋白分子量介于21 463.75～23 587.2Da;6个MdoROP蛋白的亲水性介于-0.125～-0.077且均为负值,6个MdoROP蛋白均为碱性亲水蛋白,均定位于细胞膜、细胞质和细胞核且均不具有信号肽和跨膜结构域;MdoROP蛋白的二级结构元件以无规则卷曲和α螺旋为主。[结论]6个MdoROP蛋白属于苹果小G蛋白ROP家族,是磷酸化蛋白和碱性亲水蛋白,均不是分泌蛋白和膜蛋白;无规则卷曲和α螺旋是6个MdoROP蛋白的主要二级结构,ROP基因三级结构的预测结果与二级构造相吻合。该文研究结果将为后续深入研究MdoROP蛋白的生物学功能奠定强有力的基础并提供理论支撑。

• 单位
  塔里木大学