基于内质网应激相关基因的鼻咽癌预后模型的构建与验证

作者：王月; 喻国冻^*

来源：肿瘤学杂志, 2023, 29(09): 767-776.

[目的]探究内质网应激（endoplasmic reticulum stress,ERS）相关基因对鼻咽癌（nasopharynx cancer,NPC）患者生存预测价值，构建基于ERS相关基因的NPC预后模型。[方法]从MsigDB和Genecards数据库中筛选ERS相关基因，并纳入到单因素Cox回归和LASSO回归，构建基于相关基因的NPC预后相关的风险评分模型，并用外部数据集进行验证。此外，纳入临床数据和风险评分构建列线图模型，探索风险评分与免疫治疗反应之间的关系。最后，通过qRT-PCR探索NPC特征基因的表达情况和功能。[结果]经分析获得1 631个ERS相关基因，其中167个ERS相关基因在鼻咽组织中差异表达，上调26个，下调141个。筛选出5个具有统计学差异的基因，其中SPAG8、P4HTM、MLF1、GOLGA2在NPC组织内表达水平低于正常鼻咽组织，而GADD45A在NPC组织内表达水平高于正常鼻咽组织。基于这5个ERS相关基因构建风险评分模型。风险评分=（1.597×GADD45A+1.202×SPAG8+1.309×P4HTM+1.47×MLF1-1.586×GOLGA2）。风险评分模型预测1～3年生存率受试者工作特征曲线，曲线下面积分别为0.756 9,0.809 3和0.718 7。高风险组B记忆细胞显著性低于低风险组（P<0.001），而树突状细胞浸润比例显著性高于低风险组（P<0.05）。qRT-PCR验证4种ERS相关基因（SPAG8、P4HTM、MLF1、GOLGA2）在NPC组织中的表达水平均低于癌旁组织（P<0.05）,1种ERS相关基因（GADD45A）在NPC组织中的表达水平高于癌旁组织（P<0.01）。[结论]基于GEO数据库构建5个ERS相关基因组成的风险评分模型，列线图模型均能较准确地预测NPC患者预后，对NPC预后评估以及高风险群体筛查具有一定的参考价值，对NPC患者免疫治疗有一定的指导价值。

• 单位
  贵州医科大学