基于转录组数据对陆地棉GhHMP1的克隆及表达分析

作者：韩明格; 王晓歌; 杨笑敏; 王德龙; 王俊娟; 王帅; 郭丽雪; 樊伟丽; 陈超; 叶武威^*

来源：分子植物育种, 2018, 16(17): 5534-5539.

DOI：10.13271/j.mpb.016.005534

• 棉花
• 镉胁迫
• GhHMP1
• 基因克隆
• 表达分析

本研究就转录组数据分析得到一个与镉胁迫相关的基因GhHMP1(Heavy metal transport/detoxification superfamily protein1),并从陆地棉耐镉品种‘邯242’中克隆成功。为研究该基因的功能和特点,对其进行生物信息学分析、转录组分析和实时荧光定量表达分析。结果表明:陆地棉‘邯242’基因GhHMP1的CDS全长为402 bp,编码133个氨基酸,分子量约为14.88 kD,等电点为8.20;转录组和实时荧光定量分析表明,GhHMP1基因的表达具有组织特异性,且受镉胁迫诱导,可以作为重要的候选基因来培育棉花耐镉新材料,从而为棉花耐镉育种及修复重金属污染土壤提供重要的理论依据。

• 单位
  新疆农业大学; 中国农业科学院棉花研究所; 棉花生物学国家重点实验室