骨肉瘤与尤文肉瘤关键基因CDC5L及其生物学功能的生物信息学分析

作者：冯娜; 宋文霞; 邵立平; 高宇航; 赵承武^*

来源：中国骨伤, 2022, 35(03): 276-280.

• 骨肉瘤
• 尤文肉瘤
• 生物信息学分析
• CDC5L

目的:利用生物信息学方法筛选骨肉瘤(osteosarcoma,OS)和尤文肉瘤(Ewing's sarcoma,EWS)关键基因及通路预测。方法:检索GEO数据库OS(GSE16088)及EWS(GSE45544)数据集,利用GEO2R分析差异基因,韦恩图筛选共同参与两者发生的关键基因,对该基因进行GO、KEGG通路分析及蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络分析,并利用UCSC进行该基因的转录因子预测,GEPIA分析转录因子与目的基因之间相关性。结果:通过对OS及EWS数据集差异性及维恩图分析,结果显示细胞分裂周期5样蛋白(cell division cycke 5-like,CDC5L)基因为参与OS及EWS发病的关键基因。该基因主要参与有丝分裂过程,与RNA代谢、Pre-mRNA内含子的处理、mRNA及Pre-mRNA的剪接等信号通路。结论:CDC5L作为关键基因,在OS及EWS进展中发挥促癌基因的作用,可能是两种原发恶性肿瘤可靠的诊疗靶点。

• 单位
  吉林大学第一医院