基于RNA-Seq转录组测序技术揭示肉兔生长发育调控的分子机制

作者：邝良德; 雷岷; 张翔宇; 李丛艳; 郑洁; 郭志强; 任永军; 张翠霞; 杨超; 唐丽; 谢晓红^*

来源：基因组学与应用生物学, 2020, 39(02): 539-546.

DOI：10.13417/j.gab.039.000539

• 肉兔
• 转录组测序
• 生长发育
• 分子机制

为研究肉兔肌肉生长发育调控的分子机制,本试验以84日龄齐卡巨型白兔和齐兴肉兔为研究对象,屠宰后取背最长肌组织并提取总RNA,反转录建立c DNA文库,利用Illumina HiSeq 2500测序平台进行测序,并进行序列分析和注释。筛选与肉兔肌肉生长发育相关的信号通路及差异表达基因,最后进行荧光定量PCR验证。结果表明:齐卡巨型白兔和齐兴肉兔背最长肌中显著差异表达基因总数为833个,其中齐卡巨型白兔中显著上调基因325个,显著下调基因508个。KEGG功能注释发现差异基因显著富集到PI3K-AKT通路、癌症通路和黏着斑通路,最终筛选出4个可能与生长发育显著相关的差异表达基因,为进一步对肉兔进行遗传改良提供了理论基础。

• 单位
  四川省畜牧科学研究院